MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus warneri SG1 plasmid pSZ4

Total Repeats: 108

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020165	ATC	2	6	29	34	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_020165	TAAT	2	8	86	93	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020165	TAA	2	6	129	134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020165	ACA	2	6	135	140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_020165	ATG	2	6	164	169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020165	AC	3	6	227	232	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_020165	GAT	2	6	277	282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020165	GA	3	6	285	290	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020165	A	6	6	290	295	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020165	TAAA	2	8	410	417	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020165	GA	5	10	485	494	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020165	GAA	2	6	602	607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020165	TCA	3	9	627	635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_020165	GA	3	6	672	677	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020165	ACATC	2	10	690	699	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
16	NC_020165	CGA	2	6	714	719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	445060930
17	NC_020165	TGA	2	6	844	849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	445060930
18	NC_020165	AAG	2	6	867	872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	445060930
19	NC_020165	ATC	2	6	877	882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	445060930
20	NC_020165	A	6	6	897	902	100 %	0 %	0 %	0 %	445060930
21	NC_020165	AAT	2	6	934	939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	445060930
22	NC_020165	GTTA	2	8	961	968	25 %	50 %	25 %	0 %	445060930
23	NC_020165	AT	3	6	1008	1013	50 %	50 %	0 %	0 %	445060930
24	NC_020165	AGCA	2	8	1027	1034	50 %	0 %	25 %	25 %	445060930
25	NC_020165	TTTG	2	8	1064	1071	0 %	75 %	25 %	0 %	445060930
26	NC_020165	TTG	2	6	1098	1103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	445060930
27	NC_020165	GGT	2	6	1109	1114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	445060930
28	NC_020165	TTTA	2	8	1115	1122	25 %	75 %	0 %	0 %	445060930
29	NC_020165	A	7	7	1141	1147	100 %	0 %	0 %	0 %	445060930
30	NC_020165	T	7	7	1157	1163	0 %	100 %	0 %	0 %	445060930
31	NC_020165	TAT	2	6	1178	1183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020165	ATT	2	6	1284	1289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020165	TCG	2	6	1303	1308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_020165	AAT	2	6	1326	1331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020165	TTA	2	6	1363	1368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020165	TAAA	2	8	1387	1394	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020165	AGG	2	6	1407	1412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020165	AAG	2	6	1427	1432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	445060931
39	NC_020165	T	6	6	1433	1438	0 %	100 %	0 %	0 %	445060931
40	NC_020165	GTT	2	6	1448	1453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	445060931
41	NC_020165	AATG	2	8	1522	1529	50 %	25 %	25 %	0 %	445060931
42	NC_020165	AAC	2	6	1576	1581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	445060931
43	NC_020165	T	7	7	1583	1589	0 %	100 %	0 %	0 %	445060931
44	NC_020165	A	8	8	1601	1608	100 %	0 %	0 %	0 %	445060931
45	NC_020165	ATA	2	6	1611	1616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	445060931
46	NC_020165	AT	4	8	1708	1715	50 %	50 %	0 %	0 %	445060931
47	NC_020165	AT	7	14	1724	1737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020165	AGG	2	6	1811	1816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020165	GTAT	2	8	1823	1830	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020165	GGAATA	2	12	1846	1857	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020165	TAA	3	9	1896	1904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020165	A	7	7	1942	1948	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020165	T	7	7	1984	1990	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020165	ATA	2	6	2015	2020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020165	TAA	2	6	2047	2052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020165	A	8	8	2059	2066	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020165	GTC	2	6	2070	2075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_020165	ACATTT	2	12	2185	2196	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_020165	GAC	2	6	2209	2214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_020165	T	6	6	2240	2245	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020165	GAA	2	6	2252	2257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	445060932
62	NC_020165	TTAC	2	8	2269	2276	25 %	50 %	0 %	25 %	445060932
63	NC_020165	T	7	7	2338	2344	0 %	100 %	0 %	0 %	445060932
64	NC_020165	ACC	2	6	2345	2350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	445060932
65	NC_020165	TTG	2	6	2385	2390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	445060932
66	NC_020165	TAA	2	6	2398	2403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	445060932
67	NC_020165	TA	3	6	2508	2513	50 %	50 %	0 %	0 %	445060932
68	NC_020165	TAA	2	6	2578	2583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	445060932
69	NC_020165	ATG	2	6	2592	2597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	445060932
70	NC_020165	GAT	2	6	2639	2644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	445060932
71	NC_020165	AGATT	2	10	2654	2663	40 %	40 %	20 %	0 %	445060932
72	NC_020165	GAA	2	6	2678	2683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	445060932
73	NC_020165	ATT	2	6	2694	2699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	445060932
74	NC_020165	GTGATA	2	12	2781	2792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	445060932
75	NC_020165	ATTC	2	8	2794	2801	25 %	50 %	0 %	25 %	445060932
76	NC_020165	TAA	2	6	2809	2814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	445060932
77	NC_020165	AATT	2	8	2848	2855	50 %	50 %	0 %	0 %	445060932
78	NC_020165	TGA	2	6	2923	2928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	445060932
79	NC_020165	AT	3	6	2934	2939	50 %	50 %	0 %	0 %	445060932
80	NC_020165	A	6	6	2964	2969	100 %	0 %	0 %	0 %	445060932
81	NC_020165	AGCA	2	8	2976	2983	50 %	0 %	25 %	25 %	445060932
82	NC_020165	GAA	2	6	3005	3010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	445060932
83	NC_020165	TAAATA	2	12	3040	3051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	445060932
84	NC_020165	TTAA	2	8	3059	3066	50 %	50 %	0 %	0 %	445060932
85	NC_020165	AAT	2	6	3176	3181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020165	GTT	2	6	3190	3195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020165	T	6	6	3200	3205	0 %	100 %	0 %	0 %	445060933
88	NC_020165	AGAA	2	8	3207	3214	75 %	0 %	25 %	0 %	445060933
89	NC_020165	AT	3	6	3229	3234	50 %	50 %	0 %	0 %	445060933
90	NC_020165	A	7	7	3235	3241	100 %	0 %	0 %	0 %	445060933
91	NC_020165	TA	3	6	3328	3333	50 %	50 %	0 %	0 %	445060933
92	NC_020165	ATTA	2	8	3366	3373	50 %	50 %	0 %	0 %	445060933
93	NC_020165	GTA	2	6	3377	3382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	445060933
94	NC_020165	TAT	2	6	3455	3460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	445060933
95	NC_020165	ACC	2	6	3531	3536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_020165	T	6	6	3598	3603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020165	ACG	2	6	3679	3684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_020165	TTTC	2	8	3752	3759	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_020165	GAA	2	6	3760	3765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020165	GTG	2	6	3769	3774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020165	TGA	2	6	3780	3785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	445060934
102	NC_020165	CGA	2	6	3811	3816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	445060934
103	NC_020165	TAAG	2	8	4023	4030	50 %	25 %	25 %	0 %	445060934
104	NC_020165	TGA	2	6	4138	4143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	445060934
105	NC_020165	CAA	2	6	4151	4156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	445060934
106	NC_020165	CAAT	2	8	4190	4197	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_020165	AGA	2	6	4215	4220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020165	ATC	2	6	4257	4262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.